恐無證兒童湧至香港 修訂入境條例引爆爭議
於是，在回歸後一星期，約400名非法入境，但符合《基本法》永久性居民條件的港人內地所生子女，向入境事務處自首，吳嘉玲為其中一人。（詳見下頁 吳嘉玲案）時任入境處處長葉劉淑儀，不得不承認基於《基本法》第24條，這些港人在內地所生子女擁有香港永久性居民身分。然而，政府憂慮如果「無證兒童」 一下子湧入，香港恐難以負荷，於是拒絕給予這四百多人香港身分證，並於一九九七年七月十日，向臨時立法會提出修訂入境條例（1997年入境(修訂) (第5號)條例），規定該類人士要提供《居留權證明書》才可享有居港權。
本來符合《基本法》永久性居民條件的內地子女，變相需要向所在地的公安機關申請《居留權證明書》，而居留證每年均有配額限制。
吳嘉玲案 引發首次人大釋法
背景 吳嘉玲在內地出生，父親是香港人。根據《基本法》（看右頁第24條條文），她應該享有居港權，但經入境條例修訂後，她沒有《居留權證明書》，便要被遣返。吳在父親代表下，入稟高等法院指「1997年入境(修訂) (第5號)條例」違憲，提出司法覆核。
裁決 一九九九年一月二十九日，終審法院宣判，港府在「吳嘉玲案」中敗訴，確認吳嘉玲享有永久居民身分。
判決指，香港永久居民所生子女都享有居港權，「不論是否婚生，不論是否擁有單程證，亦不論是否生於中國」，變相推翻入境條例的修訂。
影響 當時的保安局局長葉劉淑儀於立法會表示，估計十年內會有167萬人從內地移居香港，政府憂慮會帶來沉重的人口壓力，所以聯同時任律政司司長梁愛詩，代表香港政府向全國人大常委尋求釋法。
沉默是律師最大的抗議聲音
一九九九年六月三十日，人大釋法後的數天，法律界曾「沉默遊行」表達不滿。600多名法律界人士穿著黑衣遊行。「律師一向非常『建制』，所以我們有遊行是匪夷所思。」梁家傑憶述：「我們在終審法院的門口默哀，然後解散，全程沒有喊過半句口號。」處理莊豐源案的資深大律師李志喜亦有參與當年的遊行，她還記得當時有人發起了遊行，便一呼百應，不用慢慢打電話。