不效力建制 三成大專幹事退會
去年五月，專上同盟西貢區幹事會籌備「職業生涯探索計劃」，就邀請嘉賓與同盟的核心成員出現分歧，釀成了退會潮。西貢區幹事家熙(化名)指，當時正在為高中學生舉辦學長計劃，並已邀請各個界別的知名人士作嘉賓，例如有傳媒界毛孟靜、法律界余若薇、涂謹申等：「我們向核心成員匯報活動進展，他們指我們的嘉賓名單政治光譜太『右』，要我們腰斬活動，並說如果我們繼續辦，就不會承認我們是專上同盟的成員。」
林仔指，當時專上同盟召開了一個聯區會議，會上陳一諤直斥「職業生涯探索計劃」的理念跟專上同盟成立原意不同。「那時我想，邀請泛民嘉賓與你本身成立組織的原意相違背，那麼，你成立這個組織是希望幹甚麼的呢？」最後，專上同盟以「不按照程序辦事」為由辭退西貢區整個幹事會。家熙強調，早在專上同盟辭退他們前，他們已發聲明主動退會。
林仔指，在西貢區事件發生前，早已察覺同盟有明顯親建制背景，並計劃和幾個同學退會：「西貢區事件是今次的導火線。」他表示，事後，他們更加肯定專上同盟的親中路線，於是，他便和幾位成員一起游說其他數十位成員退會。「不想跟親建制力量有關係，是大家的底線。」一個月後，他們「拉走了」三十多名大專幹事，約是專上同盟大專成員總人數的三成。
連帶失去中學部 同盟勢力銳減
除了大專部的成員大量流失，專上同盟的中學部更是全軍覆沒，三區中學部最終只成立了一年多就結束，前中學部成員歸咎於專上同盟的親中背景。家寶指：「當時有不同的新聞報道，都在談論專上同盟是『紅色』的，令到大家有擔憂。我們不希望有政治背景的東西這麼快就落到中學生層面，我不認為中三、中四的學生要接觸這些東西。」
阿鋒表示：「目的很簡單，不想有任何政治立場。若再繼續招收下屆幹事會，可能會對中學和學生都有影響。」由於不想與建制勢力扯上關係，九龍區和港島區中學部於去年不理專上同盟的挽留，宣布脫離同盟，自行另組新閣。
而新界區中學部亦無視專上同盟要他們物色來屆幹事會成員的要求，讓新界區幹事會「自然死亡」。前新界區中學部幹事詠兒(化名)解釋：「我相信大家都不願意令朋友深陷於被傳媒負面報導的組織裡吧！」
專上同盟中學部全面瓦解，大專部今年亦只餘下五區幹事會，部份職位更需由上屆幹事擔任，勢力大不如前。本刊曾多次接觸專上同盟的負責人，要求回應，但截稿前仍未收到回覆。
另一學生組織學民思潮發言人張秀賢認為，專上同盟是親左派的學生組織。不過，現時除了專上同盟外，還有很多學生團體在做類似的事。他指，左派學生組織邀請學生加入時，往往會隱瞞組織的政治背景，強調可以容納不同政見，學生很難提防。他提醒，大部分左派學生組織不會在活動上涉及政治參與，反而會為學生「去政治化」，使學生對政治冷感，同學在參加活動時，除了機構的活動內容外，可試從機構顧問的身分背景、資金來源和活動規模上估計組織的政治背景。