相關研究尚未發展成熟
不過，有學者卻質疑天賦基因檢測的科技並未成熟。香港中文大學生物醫學學院助理教授蘇漢昌解釋，這類檢測的科學基礎嚴謹程度有待改善，現時仍有很多不確定性。市面上有些公司只以單一SNP上的序列組合作基準來斷定先天能力或天份，蘇教授認為這並不恰當。他指出，單一SNP通常不能單獨對某特質起決定性影響，對於大部分特質的影響都少於1%。
天份是一個複雜的個人特質，要構成一種天份，需要很多不同的基因去配合，不是一兩個基因便能控制。
他表示行為與基因的關係很複雜，現時科學界仍未能確切肯定基因對構成一項天份，即在某個行為上的優勢有多大影響。「天份是一個複雜的個人特質，要構成一種天份，需要很多不同的基因去配合，不是一兩個基因便能控制。」他指出根據目前的科技，科學界還沒能找出控制某個天份的所有基因組，難以斷定某個基因是否很大程度上與某個天份有關。他強調，GWAS的研究成果在統計學的角度上只是顯示「某個特質與基因有關聯」，但兩者之間也僅限於有關聯（Association），並不是必然的因果關係（Causation），存在某個基因並不代表某方面肯定有優勢。
對於有公司聲稱能夠檢測一些特質如可塑性、熱情、感性及專一等，他表示比起與疾病相關的基因研究，這方面的研究比較初步，樣本數量也不多。對於把尚未發展成熟的研究作檢測的科學根據，蘇教授對此做法有保留：「大部分與精神和心理上有關的特質，如性格和情商等，受多種因素影響，包括成長環境及後天影響等，往往難以找到與基因之間強而有力的關聯。」
基因突變優勢可隨時消失
香港中文大學生物醫學學院副教授李天立補充，採用甚麼種族（Race）或群體（Population）的基因數據、樣本大小及分析假設對預測的準確性也有影響。由於每個基因變異的比率在不同群體都有差別，若公司單以外國人的數據分析亞洲人，得出的結果便有機會不可靠，影響預測的準確性。
他認為在醫學界中準確度受肯定的，是一些檢測單基因遺傳疾病（Single Gene Disorders）的測試，如唐氏綜合症和地中海貧血症，由於這些特質只受單一基因的變異影響，因此若能在檢測者身上找到特定的基因組合，幾乎能百分百肯定檢測者擁有這個特質。
相反，受多種基因影響的疾病（Complex Diseases），如糖尿病基因測試，只能提供一些傾向性的指標，解釋患病的風險。而同樣受多種基因影響的天賦基因測試亦然，只能證明小朋友在某行為上存有優勢的傾向。要證明測試準確需要有客觀並可量度的指標，但行為、天份等較難以客觀數據量度。他亦指出，醫學界有很多與疾病相關的基因測試研究，由於樣本數量龐大，因此準確度會相對高。然而，評估天賦的基因數據較少，所以結果的準確性仍有待觀察。因此，他認為從科學根據來看，若以十分為滿分，天賦基因檢測報告的參考價值就只有三分。
他認為基因會受後天的環境因素所影響，即使小朋友天生擁有某個基因，令他在某個行為上的表現有優勢，這個所謂與生俱來的天份也可以隨著基因突變而消失，相反亦然。故建議家長只把基因報告當作參考，不必把報告的分析結果看得太重。